太湖地區(qū)水稻地方品種品質基因多樣性及部分淀粉品質性狀與SSR標記的關聯(lián)研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、太湖稻區(qū)歷史悠久,積累了豐富的水稻地方品種資源。研究地方品種資源的遺傳多樣性可為優(yōu)質資源的保護和利用以及新品種的選育提供一些參考。本研究一方面以太湖地區(qū)549份水稻地方品種為供試材料,選用23個與淀粉合成相關的基因內分子標記對其淀粉品質基因型進行檢測,分析太湖地區(qū)地方品種中的品質基因多樣性,整理出地方品種中所包含的淀粉相關基因的基因型,并與來源廣泛的92份現(xiàn)代育成品種進行比較研究。另一方面選用48個均勻分布于水稻全基因組的SSR標記對依

2、據品質基因型差異選出的314份地方品種進行掃描,明確太湖地區(qū)水稻地方品種的群體結構和分化,并基于群體結構進行部分淀粉品質性狀與SSR標記的關聯(lián)分析。研究結果如下:
   (1)23個與淀粉合成相關的基因內分子標記在549份水稻地方品種中一共檢測到53個等位基因,平均每個基因位點檢測到2.94個等位基因。地方品種基因多樣性平均為0.2104,變幅為0.0109~0.6476;平均PIC值為0.1847,變幅為0.0108~0.58

3、64。而在育成品種中,共檢測到46個等位基因,平均每個基因位點檢測到2.56個等位基因。育成品種的基因多樣性平均為0.1749,變幅為0.0430~0.5286;平均PIC值為0.1538,變幅為0.0421~0.4199。
   (2)將所測與淀粉合成相關基因位點的等位基因進行組合,549份水稻地方品種一共整理出107種基因型,其中有65種基因型只有1個品種與之對應,其他基因型都包含幾個甚至幾十個品種。92份育成品種共整理出3

4、2種基因型,但只有3種基因型出現(xiàn)在地方品種中。糊化溫度和膠稠度在基因型間都存在著極顯著的差異。
   (3)48對SSR引物在314份水稻地方品種中共檢測到257個等位變異,平均每個位點檢測到5.35個等位變異,變幅為2~13個。其中在30個位點上檢測到稀有等位變異(頻率低于1%)41個,占全部等位變異數的16.0%。SSR水平的多樣性平均為0.3869,變幅為0.0063~0.8806;平均PIC值為0.3637,變幅為0.0

5、063~0.8688。
   (4)通過群體結構分析,314份水稻地方品種可分為5個亞群。48個SSR位點的1128種位點組合中,統(tǒng)計概率(P<0.001)支持的不平衡成對位點組合數占總位點組合數的92.6%,不平衡程度D>0.5的組合數占總位點組合數的67.0%。對于整個群體,LD在遺傳距離<150cM普遍存在。
   (5)基于群體結構的關聯(lián)分析共檢測出21個SSR位點與兩個淀粉品質性狀顯著關聯(lián)。其中,與糊化溫度顯著

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