鵝源糞腸球菌毒力因子gelE的克隆、原核表達及生物信息學分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、目的:克隆鵝源糞腸球菌毒力因子gelE基因,構建原核表達載體,在BL21中高效表達,并對其進行生物信息學分析。
  方法:
  1、根據(jù)NCBI數(shù)據(jù)庫GenBank中登錄號為:D85393.1的糞腸球菌明膠酶基因的堿基序列,利用生物信息學軟件PrimerPremier5.0和Oligo6.0設計一對特異性引物;提取鵝源糞腸球菌總DNA,做為擴增模板;PCR擴增,產物凝膠電泳分離后將目的片段回收;將回收片段與pMD18-T克隆

2、載體連接,轉化至DH5α感受態(tài)細胞中;篩選陽性克隆菌株,提取重組質粒,進行PCR及單、雙酶切鑒定,鑒定正確后送公司測序。
  2、將成功克隆的重組質粒pMD18-T-gelE進行雙酶切,回收目的片段,與原核表達載體pET-28a連接,構建pET-28a-gelE重組質粒,轉化入BL21感受態(tài)細胞中;篩選pET-28a-gelE/BL21陽性菌株,IPTG誘導表達,SDS-PAGE蛋白電泳鑒定明膠酶蛋白。
  3、利用生物信息

3、學軟件對表達的明膠酶蛋白序列進行組分、分子質量、滴定曲線與等電點等分析,預測其一級結構中糖基化位點等;根據(jù)對其可塑性、親水性、抗原性指數(shù)和表面可及性以及β-轉角、無規(guī)則卷曲等的綜合分析,預測潛在抗原表位。
  結果:成功克隆了鵝源糞腸球菌菌株毒力因子gelE基因,其堿基序列為1770bp,編碼590個氨基酸。本試驗成功構建了pET-28a-gelE/BL21表達載體,IPTG誘導蛋白表達后用SDS-PAGE方法鑒定,明膠酶蛋白為7

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