浸入邊界法及其在細(xì)胞力學(xué)中的應(yīng)用.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、在科學(xué)與工程中,尤其在生物流體力學(xué)領(lǐng)域,經(jīng)常會(huì)遇到膜結(jié)構(gòu)和流場相互作用的復(fù)雜問題。浸入邊界法是解決此類問題的一種有效方法,它的基本思想是將復(fù)雜結(jié)構(gòu)的邊界模化成Navier-Stokes動(dòng)量方程中的一種體力。浸入邊界法的主要特點(diǎn)是使用簡單的笛卡爾網(wǎng)格計(jì)算流場信息,有效地避開了生成貼體網(wǎng)格的困難,提高了計(jì)算效率。
   浸入邊界法在研究小雷諾數(shù)流動(dòng)下的大變形問題時(shí),優(yōu)勢十分明顯。細(xì)胞的運(yùn)動(dòng)就屬于這一范疇。細(xì)胞是生命的基本單位,對細(xì)胞

2、的深入研究是揭開生命奧秘、改造生命和征服疾病的關(guān)鍵。細(xì)胞主要通過改變自身形狀來抵抗外力作用,因此細(xì)胞膜的形狀在細(xì)胞運(yùn)動(dòng)過程中可能要產(chǎn)生很大的形變。研究細(xì)胞的變形和受力情況對臨床醫(yī)學(xué)和生物力學(xué)實(shí)驗(yàn)研究都有著重大的意義。
   本文研究浸入邊界法的數(shù)學(xué)性質(zhì)及其在細(xì)胞力學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用。介紹了浸入邊界法的基本內(nèi)容,探討了浸入邊界法的穩(wěn)定性和精度,開發(fā)了相應(yīng)的二維和三維的數(shù)值模擬軟件,分析了細(xì)胞在剪切流中的運(yùn)動(dòng)特性,建立了非電解質(zhì)跨細(xì)胞膜輸

3、運(yùn)的浸入邊界法模型。
   研究成果如下:
   1.通過分析跳躍模型與光滑模型兩種模型方程的特征值在不同模態(tài)下的變化,首次證明:與僅具有張力的彈性膜(抗張膜)問題一樣,抗彎膜問題的浸入邊界解法至少具有線性穩(wěn)定性。分析表明:δ函數(shù)的正則化形式緩和了浸入邊界問題的剛性;抗彎膜問題與抗張膜問題相比較具有更大的剛性,計(jì)算彎矩作用比計(jì)算張力作用更加困難;對于既有彎矩作用又有張力作用的膜,張力對低頻模態(tài)起主要作用而彎矩對高頻模態(tài)起

4、主要作用。高頻模態(tài)具有較大的衰減率和較高的振動(dòng)頻率,對于抗彎膜問題應(yīng)盡量考慮隱式時(shí)間步長格式。
   2.應(yīng)用虛擬解法研究了浸入邊界法的精度。在應(yīng)用虛擬解法證明了所用計(jì)算程序正確性的基礎(chǔ)上,拓展虛擬解法的功能,分析了具有跳躍壓強(qiáng)分布的流場的計(jì)算精度,對于四種不同階數(shù)的δ函數(shù)的正則化形式,確認(rèn)浸入邊界法只具有一階精度。證實(shí)了Peskin基于δ函數(shù)正則化形式的數(shù)學(xué)性質(zhì)對于浸入邊界法精度所作的判斷;分析了其他使用數(shù)值離散方法得到不同結(jié)

5、論的因?yàn)椤7治鼋Y(jié)果證明,改變?chǔ)暮瘮?shù)的正則化形式不能提高浸入邊界法的精度,但會(huì)影響離散誤差值。
   3.結(jié)合基本的NS方程的有限體積法求解器,研發(fā)了基于浸入邊界法的細(xì)胞膜運(yùn)動(dòng)的數(shù)值模擬軟件,實(shí)現(xiàn)了細(xì)胞內(nèi)外流場的耦合求解。自主開發(fā)的細(xì)胞膜計(jì)算程序,將膜結(jié)構(gòu)簡化為忽略厚度和彎矩作用的彈性膜,包括了Hookean模型、Neo-Hookean模型、Skalak模型和Evans-Skalak模型等四種膜的本構(gòu)關(guān)系;可用于模擬細(xì)胞在二維或三

6、維流場中的運(yùn)動(dòng),計(jì)算細(xì)胞膜表面的速度、位移、應(yīng)變和應(yīng)力等等信息。
   4.數(shù)值模擬了細(xì)胞在剪切流中的運(yùn)動(dòng),分析了細(xì)胞的運(yùn)動(dòng)特性和相關(guān)參數(shù)的影響。計(jì)算結(jié)果顯示:在剪切流的作用下,細(xì)胞在初始形狀的基礎(chǔ)上旋轉(zhuǎn)變形直到達(dá)到一個(gè)穩(wěn)定狀態(tài),膜做坦克履帶式運(yùn)動(dòng)。綜合分析二維和三維數(shù)值結(jié)果,得到以下結(jié)論:細(xì)胞穩(wěn)態(tài)的泰勒形參與真圓度和毛細(xì)數(shù)正相關(guān);細(xì)胞穩(wěn)態(tài)形狀的主軸和來流的夾角與真圓度和毛細(xì)數(shù)均呈現(xiàn)負(fù)相關(guān);膜的坦克履帶式運(yùn)動(dòng)周期隨著真圓度的增加

7、而變大;膜的本構(gòu)關(guān)系對計(jì)算結(jié)果的影響隨著毛細(xì)數(shù)的增加而顯著增大。
   5.建立了非電解質(zhì)跨細(xì)胞膜輸運(yùn)的浸入邊界法模型,該模型包括了溶質(zhì)輸運(yùn)和水的運(yùn)動(dòng),拓展了浸入邊界法在細(xì)胞力學(xué)中的應(yīng)用。推導(dǎo)了將滲透性細(xì)胞膜作為浸入邊界處理時(shí),非電解溶質(zhì)的單位流量和濃度計(jì)算公式,得到了非電解溶質(zhì)輸運(yùn)模型,并使用一維定常算例對該模型作了初步驗(yàn)證。水的運(yùn)動(dòng)直接采用原有的浸入邊界法模型,并與溶質(zhì)輸運(yùn)模型相結(jié)合,構(gòu)成了細(xì)胞傳質(zhì)的浸入邊界法模型。整個(gè)傳質(zhì)

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