大白菜抽薹開花時間與SSR和InDel標記的關聯(lián)分析.pdf

1、大白菜(Brassicacampestrisssp.pekinensis)原產中國,屬十字花科蕓薹屬蕓薹種。抽薹開花時間是重要的農藝性狀,我們有必要在分子水平探討大白菜抽薹開花時間的變異特點和遺傳基礎,從而進一步發(fā)掘優(yōu)異等位基因資源。依靠單一標記技術進行種質鑒別的支持率、分辨率有限,因此,本研究利用基因組上均勻分布的30個SSR標記和27個InDel標記,對190份大白菜種質材料進行群體結構分析,并系統(tǒng)地進行抽薹開花時間與分子標記的關聯(lián)

2、分析。群體結構分析結果有助于充分挖掘親緣關系較遠的種質資源,進而利用適宜的自交系材料試配組合,為選育優(yōu)良大白菜品種,提高育種效率提供理論依據,也是關聯(lián)分析的基礎;關聯(lián)分析可以明確群體內不同基因型中所攜帶的等位基因對目標性狀的貢獻,解釋豐富表型變異的遺傳基礎。結果如下:
　　 1.從199對隨機SSR引物中篩選出多態(tài)性高的引物24對,從36對與開花時間相關的特異SSR引物中篩選出多態(tài)性高的引物6對,從100對InDel引物中篩選出

3、多態(tài)性高的引物27對。其中24對隨機SSR引物共檢測出76個等位基因,平均每對引物檢測到等位基因3.2個,變幅為2～6個;6對特異SSR引物共檢測出15個等位基因,平均每對引物檢測到等位基因2.5個,變幅為2～4個;27對InDel引物共檢測出76個等位基因,平均每對引物檢測到等位基因2.8個,變幅為2～7個。
　　 2.將30對SSR引物和27對InDel引物產生的167個等位基因標記用于群體結構分析,Structure分析表

4、明,所選的190份大白菜材料可分為3個亞群-S1,S2和S3。S1由66份材料組成,全部為自交系;S2由72份材料組成,包括10份自交系和62份F1;S3由52份材料組成,包括4份自交系和48份F1。
　　 3.S1中材料的抽薹天數(shù)主要集中在72～99天,開花天數(shù)主要集中在83～109天;S2中材料的抽薹天數(shù)主要集中在80～99天,開花天數(shù)主要集中在90～109天;S3中材料的抽薹天數(shù)主要集中在72～89天,開花天數(shù)主要集中在8