植物化感作用代謝途徑模擬預測系統(tǒng)的構建與應用.pdf

1、生物信息學是當今比較重要和前沿的科學發(fā)展領域之一，被廣泛用于生物研究的各個方面，特別是應用生物信息學的研究方法來研究植物化感作用代謝途徑受到了國內外同行的關注。本文通過構建化感作用代謝途徑預測系統(tǒng)，應用生物信息學方法對未知序列進行比對，從而實現(xiàn)對該序列功能與代謝途徑的預測.主要結果總結如下： 1、應用改進型Smith-waterman動態(tài)規(guī)劃算法為核心構建化感作用代謝途徑模擬系統(tǒng)。并選用Java語言作為整個系統(tǒng)的開發(fā)環(huán)境，配合M

2、ySql數據庫使之在各個平臺上具有移植性與良好的交互性。 2、根據與化感作用密切相關的酚酸類代謝途徑以及萜類代謝途徑上的數據，通過NCBI上的基因序列號查詢并運用站內網頁爬行技術搜集其相關的cDNA序列以及氨基酸序列進行初始數據庫的建立以及數據的自動錄入。 3、運用本文所建立的化感作用代謝途徑預測系統(tǒng)來研究植物化感作用方面的可行性與實用性，主要是進行基因序列比對并分析比對的結果。 4、最后結合相關文獻提出使序列匹