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文檔簡介
1、目的:定量蛋白質組學技術篩選胃粘膜非典型增生(GMAH)間質蛋白質,了解微環(huán)境在胃癌早期發(fā)病過程中的作用機制。
方法:
1.采用激光捕獲顯微切割(LCM)技術,分別純化正常胃粘膜組織(NGM)和GMAH組織間質,獲取高純度的NGM和GMAH間質,經(jīng)同位素標記(iTRAQ),二維液相色譜聯(lián)用質譜(2D LC-MS/MS)技術分析,鑒定NGM和GMAH組織間質之間的差異表達蛋白質。
2.利用生物信息學軟件分析N
2、GM和GMAH間質之間蛋白質的相互作用。
3.采用Western-blot與免疫組織化學染色分析差異表達蛋白質在NGM與GMAH組織中的表達。
結果:
1.本研究采用定量蛋白質組學技術總共鑒定出GMAH間質蛋白質165個,其中GMAH組織中表達上調者99個,下調者66個。
2. GMAH間質蛋白質涉及一些與腫瘤相關的信號通路,如p53信號通路、MAPK信號通路、細胞周期與凋亡等;GMAH間質蛋白質
3、與細胞生長、增殖、代謝、凋亡、翻譯、代謝、運輸、定位和體液免疫應答等生物學過程有關,它們在STRING網(wǎng)絡中呈現(xiàn)相互節(jié)點,兩兩間相互聯(lián)系。
3.經(jīng)Western-blot與免疫組織化學染色證實S100A6和SOD3蛋白質在GMAH組織中表達存在差異,其中SOD3蛋白在GMAH組織中低表達,而S100A6蛋白高表達。
結論:采用激光捕獲顯微切割結合定量蛋白質組學技術,篩選了165個GMAH間質表達蛋白質,其中上調者99
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